线粒体组学

线粒体组学

时间:2022-8-22 14:41:34

优势:线粒体既是能量代谢中心、也是信号传递中心、更是细胞命运(凋亡或存活)的决定者,因此线粒体对于维持细胞、组织、器官的结构和功能具有重要作用。


线粒体组学:是指围绕线粒体质量控制为核心的分子生物学研究,主要聚焦于线粒体结构和功能的变化。

线粒体功能包括:线粒体膜电位、线粒体钙渗漏、线粒体ROS生成、线粒体抗氧化能力、线粒体有氧呼吸、线粒体转运、线粒体遗传、线粒体凋亡信号。

线粒体结构包括:线粒体DNA稳态、线粒体有丝分裂、线粒体自噬、和线粒体异源性(同源性)融合。

 

研究思路:

1、确立线粒体组学是否改变(功能还是结构,选择一种指标观察)

2、聚焦线粒体组学改变的分子过程(氧化、能量、凋亡、钙信号等)

3、选用线粒体组学常用的激活和挽救试剂药物,进行线粒体组学的正反实验模拟验证

 

将线粒体组学的改变上升到疾病的发病或是进展的背景中

样本获取(组织、细胞或纯化线粒体)——线粒体结构或功能检测——线粒体结构或功能检测的亚分子生物过程——线粒体组学正反实验模拟——线粒体组学在疾病中的确认

 

研究方法:

1、结构研究

a)线粒体形态学观察

i、免疫荧光技术

ii、电镜(包括普通电镜和免疫电镜)

 

b)线粒体DNA基因组稳态筛查

i、线粒体DNA的复制和拷贝数变化,qPCR法

ii、线粒体DNA的突变检测(点突变、框移突变等)

iii、线粒体SNP突变位点筛查

iv、线粒体RNA(包括tRNA)功能和含量鉴定,qPCR和WB法

 

c)线粒体特异性蛋白转位、修饰

i、线粒体凋亡蛋白(细胞色素c释放)转位检测,WB和免疫荧光法

ii、线粒体内外膜蛋白磷酸化、泛素化、乙酰化、寡聚化检测,WB或免疫荧光法

 

2、功能研究

a)线粒体呼吸功能

i、线粒体氧化磷酸化分析,线粒体呼吸测定仪检测

ii、线粒体有氧呼吸蛋白变化,WB或ELISA法

iii、线粒体代谢底物和代谢生成物检测,ELISA法

 

b)线粒体ROS(氧化应激和抗氧化能力)

i、线粒体ROS生物含量检测,流式或免疫荧光法

ii、线粒体ROS介导的磷脂或蛋白氧化:液相质谱仪或WB法

iii、线粒体ROS类型检测:荧光探针、ELISA法

iv、线粒体抗氧化蛋白含量变化:WB、ELISA

 

c)线粒体钙稳态

i、线粒体钙瞬时变化检测:钙火花(钙波)检测

ii、线粒体基线钙变化检测:流式或免疫荧光

iii、线粒体钙峰值分析:3D钙火花测定

 

d)线粒体凋亡检测

i、线粒体凋亡信号启动检测:ELISA法或免疫荧光

ii、线粒体凋亡特异性过程检测:cyt-c渗漏免疫荧光和WB法

iii、线粒体凋亡蛋白谱变化:WB或qPCR法

 

e)线粒体膜电位检测

i、线粒体膜电位单荧光检测(功能线粒体标记检测):流式或免疫荧光

ii、线粒体膜电位双荧光检测(功能和损伤线粒体双标记检测):流式或免疫荧光

 

应用范围:

1、代谢、肿瘤等疾病发病和进展的机制研究

2、线粒体(母系)遗传疾病的分子诊断和基因筛查

3、动植物代谢适应和代谢转变研究

4、细胞死亡和细胞存活的双轨研究途径

5、线粒体特异性药物的毒理学和药理学研究