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实时荧光定量PCR

时间:2022-8-23 10:49:29

实验意义:

荧光定量PCR(Realtime fluorescence quantitative PCR, qPCR)也称作实时荧光定量PCR。

即在PCR的扩增过程中,通过荧光的信号,对PCR的进程进行实时的定性、定量检测,最后通过标准曲线对初始模板进行定量分析的方法。


根据化学发光原理分为:

1、SYBR染料法

2、TaqMan探针法


SYBR染料法:

SYBR染料法利用SYBR GreenI分子的特点,SYBR Green I 是一种结合于所有双链DNA(dsDNA)双螺旋小沟区域的具有绿色激发波长的染料。SYBR Green I 只有和双链DNA结合后才发荧光,游离的染料分子不发光,在新合成链延伸过程中SYBR Green I掺入双链中,变性时DNA双链解开,SYBR Green I 游离出来,无荧光。

在PCR反应体系中,加入过量SYBRGreen I荧光染料, SYBR Green I荧光染料特异性地掺入DNA双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的SYBR Green I染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与PCR产物的增加完全同步。

SYBR染料法需要注意引物的特异性,因为非特异扩增产物和引物二具体均为dsDNA,所以SYBR染料法只能通过引物来保证特异性,SYBR染料法的优点在于简单且成本较低。



TaqMan探针法:

TaqMan探针法核心是探针分子,TaqMan探针是单链DNA,5'端偶联发光基团,3'端偶联淬灭基团,游离的完整探针是检测不到荧光信号的,发光基团发出的荧光会被淬灭基团吸收淬灭,探针被水解,发光基团和淬灭基团远离就可以检测到荧光信号。

反应开始时,模板链经热变性解链形成单链,TaqMan探针优先跟模板链退火,引物随后退火到模板上,之后进行链的延伸,延伸过程中Taq酶发挥5'-3'外切酶活性,遇到探针会从5'端逐个碱基切除探针,发光基团会跟淬灭基团分开,因此荧光检测系统可以接收到荧光信号,每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,荧光信号的累积和PCR产物形成是同步的。

TaqMan探针法的特异性除了由引物提供,更由探针分子保证,因其退火温度更高,所以TaqMan探针法特异性更好,在一个反应体系中加入多条探针,可以做多个基因同时检测。